À l'origine de Prison Break, un concept suggéré à Paul Scheuring par une de ses collègues : un homme se fait délibéremment emprisonner afin de s'évader. Bien que Scheuring pense que c'est une bonne idée, il se demande comme quelqu'un peut se lancer dans une telle histoire et comment l'adapter pour une série télévisée viable. C'est ainsi qu'il invente l'histoire du frère accusé à tord, et de la conspiration. Il commence alors l'écriture des grandes lignes du pilote, et des traits des personnages. En 2003, il propose l'idée à la Fox, qui refuse de se lancer dans une série qui s'annonce d'assez long terme. Scheuring propose alors le concept à d'autres chaines, mais essuie le même refus. La série est ensuite envisagée comme une mini-série en 10 parties, et attire l'attention de grands noms de l'industrie du film comme Steven Spielberg ou Bruce Willis. Mais le projet n'aboutit pas. Après l'énorme succès de séries de prime time telles que Lost et 24, la Fox change de stratégie et lance la production en 2004.
