Un jeune homme, Michael Scofield, décide volontairement de se faire incarcérer afin de retrouver son grand frère, Lincoln Burrows, condamné à mort pour le meurtre du frère du vice-président des Etats-Unis ! Son but... ? S'évader avec lui. Là où c'est spécial... C'est que le petit frère a tout prévu à l'extérieur. Pendant un mois, il a étudié la prison dans ses moindres détails, mais aussi ses détenus et ses employés ! Michael a tout pensé, excepté l'humain lui-même. Car, s'il connaît le passé, les penchants, les rêves et certains secrets de chacun, il a oublié un aspect majeur... Les réactions de l'Homme ! Et, en prison, elles ne sont pas toujours pavées de bonnes intentions... Et il suffit d'un détail pour que tout son plan s'écroule ! Michael s'est même fait tatouer sur tout le corps les plans de la prison dissimulés sous un habile dessin !
